Al principio de su existencia, la unidad encuentra multiples problemas, mismos que tienen que superar para poder cumplir con sus objetivos.

El primer tropiezo fue la falta presupuesto, y hasta agosto de 1980 desarrolla plenamente su programa de trabajo.

La unidad de organización y métodos ha logrado elaborar y actualizar los siguientes manuales: organización de niveles operativos en la administración central; de puestos de la administración central; de procedimientos; de organización de planteles y el directorio conalep

 También a elaborado los siguientes procedimientos de información: sistema de control de recursos humanos; sistema de control de inventarios; seguimiento del crédito del banco mundial y sistema de control escolar.